Variantes del SARS-CoV-2
Como todos los virus, el SARS-CoV-2, el virus que causa COVID-19, cambia constantemente a través de la mutación genética. Estas mutaciones genéticas pueden conducir a la aparición de nuevas variantes del SARS-CoV-2. Aunque se espera la aparición de estas nuevas variantes, algunas variantes son preocupantes para las autoridades de salud pública porque podrían propagarse más fácilmente de persona a persona, causar enfermedades más graves o reducir la efectividad de las vacunas COVID-19 actualmente disponibles. Lea más sobre las variantes de preocupación del SARS-CoV-2 y las variantes de interés en el sitio web de los CDC. CDPH participa en una serie de esfuerzos para monitorear las variantes del SARS-CoV-2 que circulan en Chicago.
Los fundamentos de las variantes del SARS-CoV-2
Todos los virus cambian constantemente y se vuelven más diversos con el tiempo a través de la mutación. Se esperan variantes del SARS-CoV-2 (el virus que causa el COVID-19), y hemos estado rastreando mutaciones desde el comienzo de la pandemia. Todas las vacunas disponibles en los Estados Unidos son protectoras contra todas las variantes conocidas de preocupación.
Las pruebas de diagnóstico, como la prueba que podría obtener de su proveedor de atención médica para ver si actualmente está infectado con el virus que causa COVID-19, detectan la presencia de todas las variantes conocidas. Para averiguar en qué variante se infectó alguien, se necesitan pruebas especializadas para leer el código genético del virus, lo que se llama secuenciación del genoma completo. Aunque la secuenciación del genoma completo es diferente a las pruebas virales de diagnóstico ofrecidas por la mayoría de los proveedores de atención médica, algunos laboratorios especializados de todo el país, incluso aquí en Chicago, pueden leer la secuencia del código genético para monitorear los cambios en el virus. La secuenciación del genoma completo no se puede realizar en todas las muestras positivas, y tarda días o semanas en realizarse en lugar de las horas o días necesarios para las pruebas de diagnóstico. Por lo general, no está permitido proporcionar información variante a las personas.
Clasificaciones de variantes del SARS-CoV-2
Si bien la mayoría de las mutaciones de un virus no afectan en gran medida cómo se comporta, algunas mutaciones pueden ser interesantes o preocupantes. Los CDC clasifican estas variantes como: variantes de interés, variantes de preocupación o variantes de alta consecuencia. Esta clasificación depende de cómo se comporte la variante: algunas de las cosas que los CDC consideran al decidir cómo clasificar una variante incluyen su capacidad para:
Una variante para la cual los datos indican un impacto potencial en las contramedidas médicas o una variante asociada con una enfermedad más grave o una mayor transmisión, pero que ya no se detecta ni circula en los Estados Unidos.
Una variante de interés puede tener marcadores genéticos específicos o mutaciones que se han asociado con cambios en la forma en que se comporta el virus, o los estudios de laboratorio pueden haber sugerido que la variante tiene algunas características potencialmente preocupantes, pero aún no se han estudiado o documentado en personas.
Una variante para la cual hay evidencia de un aumento en la transmisibilidad, la capacidad de causar una enfermedad más grave (aumento de hospitalizaciones o muertes), reducir la efectividad de los tratamientos o vacunas, reducir la protección contra la infección previa por SARS-CoV-2 o conducir a una menor sensibilidad de las pruebas diagnósticas. A partir de septiembre de 2021, la variante Delta, una variante de preocupación, es la variante más común en los Estados Unidos, y hay evidencia de que es más transmisible que los linajes anteriores de SARS-CoV-2.
Una variante de alta consecuencia tiene evidencia clara de que las medidas de prevención o las contramedidas médicas (MCM) han reducido significativamente la efectividad en relación con las variantes que circulaban anteriormente. No hay variantes del SARS-CoV-2 que se eleven al nivel de alta consecuencia a partir de septiembre de 2021.
Proporciones de variantes en los Estados Unidos y la Región 5 del HHS (que incluye Illinois):
El Programa Nacional de Vigilancia de Cepas de SARS-CoV-2 de los CDC identifica y rastrea las variantes de SARS-CoV-2 que circulan en los Estados Unidos y calcula la proporción de infecciones causadas por variantes de preocupación, tanto a nivel nacional como por región de HHS. Miles de especímenes bajo secuenciación genómica cada semana para este programa. La Región 5 del HHS incluye Illinois; elija la región 5 de HHS para ver las proporciones de variantes en la región de Chicago.
Variantes preocupantes del SARS-CoV-2 en Illinois:
El Departamento de Salud Pública de Illinois (IDPH) informa el número de variantes de preocupación reportadas al Sistema Nacional de Vigilancia Electrónica de Illinois (INEDSS). Algunos de estos resultados provienen de laboratorios que participan en el Sistema Nacional de Vigilancia de Cepas SARS-CoV-2 de los CDC descrito anteriormente.
Ver los datos del IDPH.
Variantes del SARS-CoV-2 en Chicago:
Aún más localmente, el Departamento de Salud Pública de Chicago se ha asociado con el Centro Médico de la Universidad de Rush para formar el Laboratorio Regional de Salud Pública Innovadora (RIPHL). RIPHL recolecta especímenes de hospitales en la región de Chicago y realiza la secuenciación del genoma completo para la vigilancia de la salud pública. El número de especímenes analizados en RIPHL es menor que el número realizado a través del Sistema Nacional de Vigilancia de Cepas SARS-CoV-2 de los CDC, por lo que para monitorear las proporciones de variantes, los datos de los CDC a menudo son más confiables. Los datos generados por RIPHL son particularmente útiles para las respuestas locales a los brotes y para monitorear las tendencias locales.
En el futuro, RIPHL proporcionará al CDPH capacidad de laboratorio molecular avanzada para otros patógenos de importancia para la salud pública, incluida la secuenciación del genoma completo, el biobanco de muestras clínicas positivas para SARS-CoV-2 y otros patógenos, y la bioinformática, la gestión de datos de gran volumen y el apoyo epidemiológico genómico.
Lea más sobre cómo se han utilizado los datos de RIPHL en las respuestas al brote entre equipos deportivos y en campus universitarios en Chicago.